在《神创九州》中，宗门系统是前期一个比较有意思的玩法。当达到对应境界后，便可以直接通过主界面的宗门系统随机加入对应等级的宗门（也可以通过声望堂购买信物加入指定宗门）。

不同的宗门里面会结实不同的人，并且根据宗门性质和在对应宗门待的时长，道友会得到不同程度的“正气”和“邪气”的提升。完成宗门任务会得到声望和宗门功勋的奖励。当宗门功勋达到一定程度后，可以去宗门长老处提升宗门职位，随着宗门职位的提升，可在掌门处学到的宗门技能将越多。并且在内门弟子以上便可进行闭关修炼和申请掌门指点，获得更快的修炼速度。

值得一提的是，有不少宗门有着自己的绝学，或是修炼加速的秘籍，或是特殊技能招式，至于是哪些就靠各位道友自行探索了，毕竟这也是游戏的一大乐趣（笑）。